第1集@@@@主题：命运号船员与Lucian联盟继续争夺命运号的控制权。 情节：故事紧接上集，Young上校和大多数军事人员遭到Lucian联盟的囚禁，眼看性命不保。有勇无谋的Lucian战士Dannic打算处决Young上校，但狡猾的Varro阻止了他。Varro称他们大可不必杀死Young上校和他的手下，而应该将他们流放，任其自生自灭。Dannic听从Varro的计策，通过星门将Young上校和随船的军事人员驱赶到一个寸草不生的岩石星球上。然而没过多久，Varro和几名手下也被Dannic驱赶到这颗星球。Varro称Dannic过河拆桥，以「叛徒」的名义铲除异己。Young上校决定与Varro「临时合作」。一场恐怖的电子风暴即将来临，岩石星球上的人必须尽快找到栖身之所才能逃过此劫。 与此同时，Rush博士、Brody、Chloe和Eli将自己反锁在水培实验室里，并成功获得了命运号部分能量的控制权。Rush想出了一个极为大胆的计划－－将命运号护盾中的大部分能量抽干，逼迫Lucian联盟的人投降。Rush博士提醒Varro：如果没有护盾，命运号将无法抵抗脉冲双星下一轮能量波的冲击。除了水培实验室，船上的人会死绝。然而固执的Dannic拒绝让步。 TJ. 枪后陷入昏迷。她的潜意识「去」了一个熟悉的地方－－在那里，她得知了令人震惊的消息。||第2集@@@@主题：命运号上的食品和饮用水储量告急，附近仅有一颗不稳定的星球。糟糕的是，这颗星球的星门在命运号的控制系统中属于「违禁地址」。船上的人不得不动用穿梭机前往星球表面探索。 情节：遭囚禁的Lucian联盟战士变得越来越焦躁－－他们知道船上的食品和饮用水越来越少，而他们肯定是首先被「断粮」的对象。Camille Wray与Lucian囚犯一一交谈后认为，其中有一小部分人值得信任，可以补充船上严重短缺的人手。Young上校反对Camille Wray的提议。部分Lucian联盟的囚犯发动了一场针对军人的袭击，Young上校认为他们过于危险，下令将他们流放到下一颗可以住人的星球上。 Rush博士难以忘记Lucian领袖Kiva对他的折磨，整天精神恍惚。巧合的是，在这种精神状态下，Rush居然解开了命运号的主口令并成功发现了飞船的舰桥。Rush通过舰桥发现命运号附近有一颗行星适合人居，但不知出于什么原因，命运号将这颗星球封锁在控制系统之外。这颗星球的星门似乎也坏掉了。为了尽快找到食物和水，Rush决定用舰桥指令废除飞船控制系统的「禁令」，然后怂恿Young上校派探险队乘坐穿梭机前往星球表面寻找命运号急需的东西。 Scott中尉负责带队前往。然而没等他们降落，穿梭机便遭遇了强烈的空气涡流，船上的动力系统全部失效。穿梭机坠毁在星球表面一处峡谷内，严重损毁。为了返回命运号，Scott只剩一个选择－－修复这颗星球上的星门。可是当他们发现星门的时候，令人难以想象的糟糕情况发生了……||第3集@@@@主题：命运号遇到一艘结构和设计都酷似古人风格的飞船，船员们再次看到回家的希望。 情节：一艘结构和设计都酷似古人风格的飞船在太空中漂浮，命运号的航线与其交叉，眼看就要相撞。然而当两船靠近时，竟自动减速并搭建起交换通道。命运号上的恐慌情绪很快变成了好奇。通过两船的数据交流，船员们发现那是一艘「星门播种船」（古人在命运号出发前用以传播星门的无人驾驶飞船）。 Young上校命令Scott带领一组人登上「星门播种船」寻找有价值的东西，而Rush和Eli留在命运号上研究从「星门播种船」上传递来的数据。Scott等人发现「星门播种船」上可能存有足以拨号回地球的能量。 Telford上校认为这是他们回家的好机会，于是要求Young派他参加「星门播种船」的探索行动。当Scott和Telford喜滋滋地将「星门播种船」上的能量传送回命运号时，赫然发现船上除了能量之外还有「其他东西」。||第4集@@@@Eli\s mom is sick, and Eli must rush home to see to her. Once on Earth, he realizes that she won\t come out of her depression until she realizes that he\s OK, and cares about her. Eli\s Earthly woes are matched on the ship. No one can figure out why Chloe, who\s been acting strangely, has recovered so quickly from her gunshot wound, but when she goes missing and is found in a daze in one of the cargo holds, the crew realize that she must be under some kind of residual genetic manipulation program from her abduction by the aliens. Young wants to quarantine her immediately, but Rush, who has been making huge strides in learning how to control the systems of the ship, convinces him to let her go about her life, under careful observation. He uses her vulnerable state to get her to solve an equation for him - an equation that will give him even more control over Destiny - but he continues to keep the bulk of his knowledge a secret from the rest of the crew. On Earth, Camille is reconnecting with Sharon, but the pressure of a cross-galaxy relationship is wearing on her, and domestic tensions only get higher when Camille rushes to Eli\s side to counsel him through his crisis with his mother. Young has decided to give the Lucian prisoners a trial integration with the rest of the crew, in exchange for the intel they\ve been providing, but he may have to rethink his decision when Simeon, one of the Lucians, gets inappropriate with Park. The man is locked up, and Varro attempts to patch things over - which has an effect on TJ, but the rivalry between Simeon and Greer has been ignited, and is not likely to cool down anytime soon. Brody, Park and Young are all becoming suspicious of Rush who, in a bind, shows them the equation that Chloe solved, and implies that the erratic behavior of the ship - dropping out of FTL with no gates nearby, turning off course for no apparent reason - is a result of her sabotage, at which point Young proceeds with his original plan and has her quarantined. Camille, who is unable to solve her own domestic problems, is at least able to help Eli: She orders immediate clearance for his mother, and allows her to use the communication stones to visit the ship and see, with her own eyes, the magnificent work he\s a part of. As a last-ditch effort, Rush proposes sitting Chloe in the neural interface of Destiny - the chair that made Franklin disappear - in hopes that it will burn away the alien parts of her, leaving the human part. Young and TJ reluctantly agree, and though she emerges safely, her condition remains the same, and her future - along with that everyone she\s in contact with - remains uncertain.||第5集@@@@命运号发现了一颗环境不错的星球，Scott带人前往该星球探索。奇怪的植物状生物突然袭击Scott，在他体内注入毒液。由于这种外星生物具有传染性，TJ不敢贸然把Scott带回命运号，决定「就地取材」对其进行治疗。与此同时，Scott在昏昏沉沉中梦见自己返回地球和Chloe成了婚。外星生物的感染侵入了Scott的梦境。而在现实中，更多的外星生物聚集到星门周围，Scott命在旦夕。||第6集@@@@一名正在恢复视力的年轻上校看见“命运号”飞船遭到攻击和破坏，使他觉得自己可能失去了理智。||第7集@@@@命运号遭遇一艘在太空中漂浮的飞船。虽然船体严重损坏，但看得出它属于蓝皮肤的外星人。Rush博士建议组织探险队登上这艘飞船寻找一切可以利用的数据或技术。由于命运号仅存的一架穿梭机已在第二季开始时坠毁，Rush和Young决定穿上太空服来一次「太空行走」。安全踏上外星飞船后，他们发现船上有一些空置的休眠舱，和他们前次在星门播种船上见到的那些非常相似。Rush打开这艘飞船的维生系统和能量供应后，飞船的引擎突然启动，使其向命运号相反的方向飞去。这艘船的能量很快彻底耗尽，变成了名副其实的死船。Rush仍然不愿把命运号舰桥的秘密告诉其他人，而是宣称自己研发了一种能够手动点燃命运号引擎的程序。由于「程序很复杂」，他要求Amanda Perry博士利用通讯石登船协助。Rush在老情人面前当然不会撒谎，他还亲自把她带到舰桥「参观」。有了Perry的帮助，Rush成功修正了命运号的航向，使其返回受损飞船所在的位置。但Eli却把他们的秘密告诉了其他人，令Rush十分懊恼。Young得知此事后和Rush大吵了一架。||第8集@@@@故事承接上一集：Ginn利用通讯石与Amanda Perry博士交换了身体。星门指挥部要求Ginn提供Lucian联盟密谋袭击地球的所有情报。Simeon担心Ginn会透露敏感信息，于是杀死警卫逃出囚室，将Ginn的身体（Perry博士的记忆）「杀死」。Simeon将Park当作人质，迫使Volker拨通了附近一颗星球上的星门，然后逃离了命运号。Rush发现Ginn已经冰冷的尸体后，知道自己的老情人也难逃此劫，发誓要报复Simeon。但星门指挥部认为Simeon可能掌握了Lucian联盟攻击地球的重要情报，命令命运号必须活捉Simeon。Scott和Greer立即动身前往Simeon和Rush所去的星球－－如果他们不够及时的话，Simeon和Rush肯定会拼个你死我活。||第9集@@@@第一季被留在外星球上的那帮船员突然乘坐一架穿梭机回归，T.J.重新燃起了寻找女儿的希望。这些人自己也说不清是怎么回来的－－包括Caine博士在内，所有人关于这段经历的记忆都被抹除了。 Young担心这是外星人的「杰作」，下令将Caine等人隔离观察。T.J.对他们进行了严格的体检，发现他们尽管身份无误，但身上没有任何问题－－一点小毛病都没有。对穿梭机的检查也发现了同样的蹊跷：这架穿梭机是全新的。不久后，一名回归者突然倒地身亡，令命运号上的气氛骤然紧张。Camille Wray试图用「记忆回归法」唤起这些回归者失去的记忆，Young同意了她的计划。但接下来的事情却是一场灾难。 与此同时，Chloe正在加速变身过程。Chloe意识到自己在命运号上的日子已经不多了。||第10集@@@@命运号探测到航向之外的一个能量信号。Rush博士认为它可能来自某种能量源，亦或是某种外星生命所为。Rush坚持认为查明真相对命运号有百利而无一害。Young勉强同意了Rush的意见，允许他调转船头向信号源进发。 经过一整天的超光速飞行，命运号来到一个诡异的太空垃圾场。那里到处是残损飞船和各种碎片，很像是经历了一场大战－－不管是谁在这里打仗，至少已过去了一个世纪。由于命运号没有探测到任何危险，Young便命令Scott、Greer和Volker乘坐穿梭机（上集那架）近距离进行观察。Eli用命运号的系统对战场进行了模拟还原，发现那些飞船残骸大有文章。 Chloe的变化愈发明显。她认为自己再在命运号待下去只会给其他人带来危险。一个失踪已久的人突然回来「解救」Chloe，命运号上的人发现一件更大的事情正在等着他们－－与这件事比起来，绑架Chloe的外星人可谓「小巫见大巫」了。 Eli和Camille Wray用通讯石返回地球。Eli不敢把一些真相告诉母亲，而Camille Wray发现遥远的距离已经对她和Sharon的感情造成了伤害。||第11集@@@@命运号与敌方指挥舰对峙之时，曾经绑架Rush和Chloe的蓝色外星人突然出现，为即将展开的战斗增加了变数。 几个重要看点：Brody和Volker的出镜时间明显增多；特效制作师加强了对视觉效果的渲染，有些场景被重新制作了（如舰桥）；雄蜂母舰很壮观；增加了J.J.Abrams最喜欢使用的那种镜头眩光；某些单集仍然独立成章（一集一个故事，与上下集没有关联）；与Lucian联盟有关的问题不会解决，至少前三集没有；命运号上的Lucian联盟成员仍然「无所事事」；又有角色死亡，而且不止一个。||第12集@@@@Eli暗示他已经找到了让Stargate回地球的方法，这让船上的所有人激动不已，但Rush似乎对这个计划有所保留。||第13集@@@@Camille和Greer利用通讯石返回地球时，星门指挥部突然遭遇攻击，两人被困在地球上。||第14集@@@@一个大家都认为「已经死去」的人占据了Chloe的身体。与此同时，Volker博士染上了一种怪病，命在旦夕。||第15集@@@@来自《星际之门：亚特兰蒂斯》的两个重要角色将出现在《星际之门：宇宙》（Stargate Universe）第2季第15集中－－Richard Woolsey和……Rodney McKay！ Richard Woolsey、Rodney McKay、Young上校和Telford上校组成谈判组，与来自Langara星球的Ovirda大使进行谈判。他们希望Langara星球能开放naquadria核心，以便获得充足的能量与命运号建立直接连接。||第16集@@@@命运号停靠在一颗星球外，Young命令探险队到星球表面寻找补给品。然而探险队遭到一种外星生物的伏击，两名队员被俘虏。与此同时，命运号上的人发现了古人储藏的新技术，但这却给Brody带来了麻烦。这一集Greer是主角，但也将讲述TJ的背景故事。||第17集@@@@命运号来到一座星球，发现这里有一座废弃的城市并居住着一群人类。这些人声称他们的文明是两千年前由命运号船员「创立」的。因为本集需要一批群众演员，扮演T.J.的Alaina Huffman「走后门」让她的两个儿子出现在该集当中。||第18集@@@@故事紧接上一集，命运号想把殖民地的居民送回他们的母星Novus，但却发现这颗星球因自然灾害变成了一颗无人居住的「鬼星」。更要命的是，频频发生的地震引发了毁灭性的破坏。与此同时，命运号船员从Novus的地下数据库里获得了一批极其珍贵的数据，而Rush想出了一个帮助幸存者开始新生活的方法。||第19集@@@@命运号飞入一颗恒星补充能量时遭无人驾驶的雄蜂战机袭击，特殊的能量屏障令命运号既不能吸收能量又无法离开恒星表面。船体越来越热，命运号随时可能解体并焚毁。船员们不得不通过星门逃到附近一颗行星上避难，而Eli留在命运号上冒险挽救危局。船员们在「避难星球」上意外地发现了一座废弃的城市。||第20集@@@@《星际之门：宇宙》（Stargate Universe）第二季第20集既是《星际之门：宇宙》的大结局，也是连续播了17年的《星际之门》系列（包括《星际之门》原初电影）的大结局－－至少今后数年里你都不会见到《星际之门》的新电视剧或者新电影。 本集故事延续上一集，命运号前进路线上的每一颗恒星都被敌人的母舰占领，每一个星际之门都有重兵把守。命运号既无法补充能量，也无法使用星际之门－－如果硬要冒险的话，势必招致灭顶之灾。难道命运号从此只能在无穷无极的宇宙中漂流？ 制片人表示，这一集与第10集有关联，特别是命运号发现的那座「太空船坟场」。 本集当初并非当作剧终集来创作的，因此宇宙背景辐射、古人的秘密、创造星系的神秘力量、Lucian联盟、蓝皮肤的外星人……这些没有答案的秘密将成为永远的秘密！
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